Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms