Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms