Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms