Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms