Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM5BQ9UGL1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms