Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APEX2Q9UBZ4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms