Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM8A1Q9UBU6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM8A1Q9UBU6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms