Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms