Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9Q9P2J2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms