Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDE1Q9NXR1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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