Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf109Q9NX04 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms