Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC22A11Q9NSA0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms