Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHAF3Q9NRP4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDHAF3Q9NRP4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SDHAF3Q9NRP4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms