Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE7BQ9NP56 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms