Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms