Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms