Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms