Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms