Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PI4K2AQ9BTU6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms