Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms