Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms