Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms