Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms