Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CAVIN3Q969G5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms