Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms