Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC4Q8WW27 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms