Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms