Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms