Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMNTD2Q8IXW0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms