Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms