Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms