Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms