Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms