Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3EQ6PEY2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms