Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3F3CQ6NXT2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms