Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX3

TCEAL6, Transcription elongation factor A protein-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL6Q6IPX3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEAL6Q6IPX3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEAL6Q6IPX3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms