Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms