Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms