Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms