Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms