Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms