Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms