Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms