Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5B1Q2VPB7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms