Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MSMPQ1L6U9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms