Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DDB1Q16531 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms