Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms