Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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