Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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