Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms